水に愛され続けた彼は、泳いだ先に何を掴むのか──

水泳を通じて絆を育んだ仲間たち。歩み続けたかけがえのない日々。
彼の泳ぎは見るものを魅了し、その心を掬い上げ、幾度も奇跡を起こした。

やがて少年は青年へ。
それぞれの道へ歩き出した仲間たちの姿。
すべての想いを胸に、挑む舞台は＜世界＞。

七瀬遙は問い続ける。

なぜ、泳ぐのか？
何のために、泳ぎ続けるのか？

泳いだ先にある未来へ、"見たことのない景色"へ、彼は挑む──。

高知の自然豊かな村に住む17歳の女子高生・すずは幼い頃に母を事故で亡くし、父と二人暮らし。

母と一緒に歌うことが何よりも大好きだったすずはその死をきっかけに歌うことができなくなっていた。

いつの間にか父との関係にも溝が生まれ現実の世界に心を閉ざすようになっていく。

曲を作ることだけが生きる糧となっていたある日
偶然にも、全世界で50億人以上が集う超巨大インターネット空間の仮想世界＜U＞に「ベル」というキャラクターで参加することになる。

もうひとりの自分。
もうひとつの現実。
もう、世界はひとりひとつじゃない。

＜Ｕ＞では自然と歌うことができたすず（ベル）は自ら作った歌を披露し続けていく内にあっという間に世界中の人気者になっていく。

そんな驚きも束の間
突如轟音とともにベルの前に現れたのは竜の姿をした謎の存在だった―。

世界中の“個性”保持者の殲滅を目論む謎の組織・ヒューマライズ。
彼らが各国に仕掛けた、“個性”を暴走させ崩壊に導く爆弾＜個性因子誘発爆弾（イディオトリガーボム）＞から人々を救うため、世界選抜ヒーローチームが結成。世界各国のプロヒーローと、ヒーロー事務所でインターン中だった雄英高校ヒーロー科の生徒たちが招集され、各地で爆弾の回収任務にあたっていた。

エンデヴァー事務所でインターン中のデク・爆豪・轟の３人も、日本から遠く離れた国＜オセオン＞で作戦行動中、ある事件に巻き込まれたデクがなんと全国指名手配されてしまう！ 事件をきっかけに出会った運び屋の少年・ロディとともに、警察や謎の敵（ヴィラン）集団から命を狙われるデクたち。その影で巨大な陰謀が動き出し……。

そして、ヒューマライズ指導者、フレクト・ターンからの犯行声明が全世界に届く―
「タイムリミットは今から２時間」

各国で発生するパニック、刻一刻と迫りくる世界崩壊へのカウントダウン。
ヒーローチームは絶体絶命の状況下で、危険を顧みずに各地の爆弾回収に向かう―

ヒロアカ史上最大の危機に、世界の、そしてヒーロー達の未来が、“彼ら”に託された。